近日，深海生物学研究室张海滨研究团队在期刊Frontiers in Genetics上发表了题为 “Molecular Response to High Hydrostatic Pressure: Time-Series Transcriptomic Analysis of Shallow-Water Sea Cucumber Apostichopus japonicus”的文章。硕士生陈家炜为论文第一作者。
研究团队使用高压培养装置模拟深海高压环境，通过转录组分析浅海仿刺参对压力胁迫的分子响应。实验包括：1.高压环境时间序列(1–24 h)培养；2.进行高压(25 MPa)培养后，在常压条件下时间序列恢复(0.5–48 h)培养。
研究发现，参与基因信息传递的bZIP转录因子是对压力变化最敏感的基因家族，在高压培养2–4小时后开始显著高表达。接下来产生响应的生物学过程是泛素化和细胞内吞，与这两个生物学过程相关的基因家族分别在高压培养4小时和6小时后开始显著高表达。
另外，研究发现大部分基因在受到高压胁迫后立即开始调整表达水平（此时尚未检测到显著差异），上调或者下调的速率随时间增加逐渐降低；解除高压胁迫后，大部分基因立即开始恢复（此时依旧可以检测到显著差异），恢复速率随时间增加逐渐降低（如图示）。因此在深海无脊椎动物的采样过程中，非原位固定样品应该尽量在4小时内完成固定。
聚类分析、差异表达分析和主成分分析结果
P0–P24:高压培养0–24小时
R0.5–R48：常压恢复0.5–48小时
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