科研进展--中国科学院广州分院

南海海洋所 | 研究团队揭示三大洋增暖协同驱动华南极端降水机制

近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境实验室（LTO）、全球海洋和气候研究中心（GOCRC）以及中国-斯里兰卡热带海洋环境“一带一路”联合实验室（CSTO）的王春在研究员团队，在热带三大洋协同驱动华南极端降水研究方面取得新进展。相关研究成果以“Pan-tropical ocean warming drives record-breaking rainfall in South China in April 2024”为题，发表于Nature子刊Communications Earth & Environment。论文第一作者为研究员邢雯，通讯作者为研究员王春在。华南是我国暴雨和洪涝灾害高发地区，春季降水不仅关系农业生产，也会影响后续汛期的洪涝风险。2024年4月，华南遭遇历史罕见的极端降水，造成严重的社会经济损失。以往研究表明，厄尔尼诺、印度洋和北大西洋海温异常均可影响华南春季降水，但大多关注单一洋盆的作用。2024年春季，热带中东太平洋、西印度洋和北大西洋同时出现异常显著增暖，三大洋海温异常是否共同驱动了此次极端降水？不同海盆贡献有何差异？目前尚缺乏系统认识。针对这一问题，研究团队利用全球降水、海表温度和大气再分析资料，研究了2024年4月华南极端降水的环流背景，并通过大气模式试验，分别评估了三大洋海温异常的影响及相对贡献。结果表明，2024年4月华南区域平均降水达到1979年以来最高值，部分地区累计雨量超过1000毫米，约为常年同期的5倍。西北太平洋副热带高压异常北抬，其北界较常年偏北约5°，达到1979年以来最北位置，大量暖湿水汽因此持续输送至华南。同时，鄂霍次克高压增强，推动冷空气南下。暖湿气流与冷空气在华南上空交汇，使大气层结更加不稳定，为持续性强降水创造了有利条件。进一步分析发现，极端降水发生前，热带中东太平洋、西印度洋和北大西洋均出现了破纪录的海表增暖，其中印度洋和北大西洋的异常强度接近3个标准差。模式试验表明，三个海盆的增暖均可增强西北太平洋副热带高压及水汽输送，促进华南降水增加。其中，热带太平洋贡献最大，但印度洋和北大西洋的影响同样显著；此外，印度洋和北大西洋增暖还可增强鄂霍次克高压，促进冷空气南下，进一步放大华南降水。研究表明，此次华南破纪录极端降水并非由单一洋盆驱动，而是热带中东太平洋、西印度洋和北大西洋异常增暖通过不同途径协同作用的结果（图1）。该研究揭示了泛热带海洋增暖及海盆间相互作用在区域极端降水形成中的重要作用，为深入认识全球变暖背景下极端降水事件的形成机制，以及提升极端降水灾害的预测预警和风险防范能力提供了新的科学依据。本研究得到国家科技部重点研发计划青年科学家项目、国家自然科学基金项目等的共同资助。图1 热带三大洋海温异常驱动2024年4月华南极端降水的机制示意图，填色代表2023年11月至2024年4月平均三大洋海表面温度异常。相关论文信息：Xing, W., Wang, C. & Liu, H. Pan-tropical ocean warming drives record-breaking rainfall in South China in April 2024. Commun Earth Environ (2026). https://doi.org/10.1038/s43247-026-03894-1.原文链接：https://www.nature.com/articles/s43247-026-03894-1

2026-08-17

南海海洋所 | 基因敲除策略下粉蝶霉素类海洋药源分子挖掘获新进展

近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态实验室、广东省海洋药物重点实验室刘永宏、周雪峰研究员团队，在海洋微生物来源粉蝶霉素类药源分子挖掘研究方面取得新进展。研究团队通过大片段基因敲除策略，显著提高了海洋微生物中粉蝶霉素类药源分子的发酵产量，拓展了其化学结构多样性，并系统评价了相关药源分子的活性、构效关系及作用机制。相关成果以“Modification Gene Knockout Diversifies Piericidins from the Marine-Derived Streptomyces psammoticus SCSIO NS126”为题，发表在美国化学会主办的国际著名学术期刊《Journal of Agricultural and Food Chemistry》（1区Top）上。海洋微生物在独特的生态环境下能产生结构新颖、活性多样的代谢产物，是创新药物与农用化学品研发的重要源泉。粉蝶霉素（Piericidins）是一类主要由链霉菌产生、具有多烯侧链和α-吡啶酮核心结构的天然产物，具有良好的药用活性。团队前期从海洋链霉菌中筛选发现了一系列具有抗菌、抗肿瘤和抗肾病的粉蝶霉素类药物先导化合物（J Med Chem 2019, 62, 7058；J Med Chem 2021, 64, 9943；Acta Pharm Sin B 2024, 14, 3232），其中多个专利获得了成果转让。为了进一步挖掘粉蝶霉素类药源分子，团队对海洋药源菌株——链霉菌Streptomyces psammoticus SCSIO NS126进行了全基因组测序，锁定了粉蝶霉素生物合成基因簇，并利用同源重组技术，对基因簇内的后修饰基因实施了分段大片段敲除，从而阻断了与主产物竞争底物的代谢支路，使代谢流更多地汇聚于粉蝶霉素的合成与积累。利用该策略，团队最终成功构建了11株突变株，粉蝶霉素总产率较野生型最高提升了7.1倍，且部分在野生型中无法检测到的微量成分也在突变株中得以大量积累。其中，通过对高产突变株（Δpie56−65）进行大规模发酵，研究人员共分离鉴定出21个粉蝶霉素类化合物，包括4个新化合物，分别为1个新苷元、2个新糖苷和1个新型类似物。活性评价与机制研究表明，所得化合物具有广谱的抗细菌和抗真菌活性（如化合物4和5分别对金黄色葡萄球菌和茄链格孢菌表现出强效抑制），其活性与选择性主要受甲基化、羟基化及糖基化等结构因素影响。该类化合物主要通过破坏病原微生物的细胞膜完整性及外部结构来抑制其生长；同时，活体实验证实化合物19在番茄感染模型中具有显著的剂量依赖性抑菌效果，充分展现了粉蝶霉素类药源分子作为新型绿色农用抗生素候选分子的巨大应用潜力。图1 基因组挖掘下的粉蝶霉素类海洋药源分子发现综上，本研究利用基因敲除策略有效丰富了海洋来源粉蝶霉素类药源分子的结构多样性并大幅提升了产量，不仅为开发新型农业抗生素提供了先导分子，也为粉蝶霉素类药源分子的工程菌株构建和规模化生产提供了重要依据。中国科学院南海海洋研究所博士研究生梁嘉琦和助理研究员蔡健为论文共同第一作者，研究员周雪峰和南方医科大学教授唐斓为共同通讯作者。该研究工作得到了国家自然科学基金区域联合重点项目、国家重点研发计划、广东省基础与应用基础研究基金、中国博士后科学基金的联合资助。论文信息：Jiaqi Liang#, Jian Cai#, Mengqin Yu, Rongxiang Qiu, Yuecheng Fang, Yonghong Liu, Lan Tang*, Xuefeng Zhou*, Modification Gene Knockout Diversifies Piericidins from the Marine-Derived Streptomyces psammoticus SCSIO NS126. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2026文章链接：https://doi.org/10.1d021/acs.jafc.6c08189.

2026-08-17

南海海洋所 | 海洋光学卫星定标研究取得新进展

近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境与岛礁生态全国重点实验室海洋智能探测与大数据技术应用研究团队在海洋光学卫星定标方面取得新进展。相关研究成果以“A Comprehensive Statistical Framework for Identifying and Assessing Optical Marine Pseudo-Invariant Calibration Sites”为题，发表在IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing期刊上（中国科学院1区TOP,IF:9.1）。论文第一作者为特别研究助理李文凯，通讯作者为研究员唐世林，共同通讯作者/合作者包括武汉大学教授田礼乔和博士陈曦、江西师范大学教授赵红梅、南京信息工程大学副教授李建、国家卫星气象中心研究员孙凌和河南科学院博士徐一楚。海洋伪不变定标场（PICS）是开展海洋水色卫星系统替代定标、交叉定标及长期稳定性监测的重要参考目标。现有研究主要依据光学和大气参数的均值、标准差或经验阈值评价候选区域，对长期变化趋势、季节稳定性及水体光谱类型变化考虑不足，难以全面刻画海洋定标场的时间稳定性。研究团队基于2002—2021年MODIS-Aqua全球长期观测数据，构建了综合考虑长期变化趋势、月尺度适宜条件出现频率和水体光谱类型稳定性的海洋PICS评价框架，并识别出北太平洋、南太平洋、大西洋及印度洋中部等一批稳定候选区域。研究进一步表明，MOBY所在北太平洋区域仍表现出较高的长期稳定性，而部分传统候选区域虽具有较好的平均光学条件，却存在明显长期变化，说明“光学洁净”并不等同于“长期稳定”。研究还利用新识别候选区域开展了MODIS-Aqua与我国HY-1D COCTS的初步交叉定标试验，验证了其作为卫星辐射一致性评价参考目标的应用潜力。该研究为海洋水色卫星定标场的全球筛选、多星交叉定标及长期海洋水色气候数据记录构建提供了新的技术支撑。图1 伪不变场识别结果与其它研究结果的对比图2 基于本文方法的典型定标海域评估结果该研究获得重点研发计划、国家自然科学基金青年项目和全重提升自主创新能力平台项目等的联合资助。论文信息：Wenkai Li, Hongmei Zhao, Jian Li, Xi Chen, Yichu Xu, Liqiao Tian*, Shilin Tang*, and Ling Sun. (2026) "A Comprehensive Statistical Framework for Identifying and Assessing Optical Marine Pseudo-Invariant Calibration Sites."IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing.原文链接：https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/11643874/

2026-08-18

华南植物园在广东江门发现樟属新种——簇序樟

广义的樟属（Cinnamomum）约有250种，广泛分布于亚洲热带和亚热带地区至西太平洋，是森林生态系统的重要组成种类。我国近年在贵州、云南发现2种樟属新植物，目前有樟属植物约50种。广义樟属分类主要依据花序着生位置、叶脉类型及芽鳞有无等形态特征，划分为樟组（sect. Camphora）和桂组（sect. Cinnamomum）。其中，樟组以叶互生、离基三出脉或羽状脉、叶腋常具腺窝、芽具鳞片等特征而区别于桂组。2024年9月，中国科学院华南植物园植物科学研究中心/国家重要野生植物种质资源库邓双文博士在广东江门古兜山省级自然保护区开展广东省植物多样性全域调查及粤港澳大湾区生物多样性调查时，采集到一种形态独特的樟属植物。研究团队综合形态学、分子系统学和物候学证据，最终确认其为新种，隶属于樟组，命名为簇序樟（Cinnamomum fasciculatum S.W.Deng & R.J.Wang）。簇序樟形态上与黄樟（C. parthenoxylon）相似，簇序樟的主要特征为叶片先端圆钝，圆锥聚伞花序着生于当年生枝端顶芽下方的苞片腋内，螺旋状互生，呈伞房状，或组成花序枝生于叶腋。目前，簇序樟仅见于广东江门古兜山省级保护区，根据世界自然保护联盟（IUCN）红色名录标准，该种暂被评估为数据缺乏（Data Deficient, DD）。研究成果以“Cinnamomum fasciculatum (Lauraceae), a new species from Guangdong, China”为题近期在线发表在国际分类学期刊PhytoKeys上。中国科学院华南植物园邓双文博士为论文第一作者，王瑞江研究员为通讯作者。该研究得到了广东省基础与应用基础研究旗舰项目、科技基础资源调查专项及国家重要野生植物种质资源库等项目的资助。论文链接：https://doi.org/10.3897/phytokeys.278.199869簇序樟花期簇序樟果期

2026-08-17

南海海洋所 | 研究揭示被动大陆边缘浅水珊瑚岛礁基座形成的地球动力学机制

近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境与岛礁生态全国重点实验室海洋地球物理与地质环境信息感知研究团队，在全球被动大陆边缘珊瑚岛礁基座形成的地球动力学机制研究领域取得新进展。相关研究成果以“Geodynamic controls on the habitable basement of shallow coral reefs at rifted continental margins”为题发表在Earth and Planetary Science Letters（一区Top）期刊上。浅水珊瑚礁是全球海洋中生物多样性最高的生态系统，供养了约25%的海洋生物。按照珊瑚礁所属构造域划分，全球超过75%的浅水珊瑚礁分布在被动大陆边缘——该构造单元由大陆板块裂解、分离形成（图1）。该空间格局表明，热带地区大陆裂离演化过程，对塑造浅水珊瑚潜在栖息环境（通常为0-30米温暖浅水海域）的时间窗口、空间分布特征起到关键控制作用。然而，同属被动大陆边缘，礁体分布格局可能截然不同：红海中北部珊瑚礁平行岸线呈窄带状紧凑分布，南海则以广阔的离散型岛礁群为特征。造成这一差异的动力机制仍缺乏系统性探索，尤其鲜有研究从地球系统科学视角出发，定量评估地质时间尺度下，深部地质演变如何通过驱动表层地貌变迁跨圈层重塑生物地理格局。图1 全球浅水珊瑚礁空间分布研究团队采用高分辨率地球动力学数值模型（ASPECT）与地表作用过程演化模型（FastScape）双向耦合的建模方案，系统模拟了从大陆裂谷到海底扩张全程的地形演化与浅水珊瑚潜在栖息环境发育过程，并以红海、南海、大堡礁、大西洋等被动大陆边缘为自然案例进行对比验证。研究结果表明：（1）大陆裂谷从早期拉张到海底扩张的完整生命周期中，均能持续形成并维持适宜珊瑚礁发育的浅海基底。研究创新性地提出了由“裂谷类型（宽/窄）”和“地表作用过程强度（强/弱）”双因子驱动的“四象限”机理分类框架（图2）。图2 裂谷类型与地表作用过程强度双因素驱动的被动陆缘浅水珊瑚礁基底特征分类方案（2）裂谷类型决定浅水珊瑚礁宜居基底空间分布特征：在不考虑地表作用过程因素时，南海等“宽裂谷”因大范围离散断裂活动，可形成大量孤立的断块岛屿与海底高地，其宜居基底面积是红海等“窄裂谷”模型的2倍以上，整体呈现岛礁零散分布的地貌特征；而“窄裂谷”多发育紧邻海岸线、侧向形态变化较小的狭窄条带状礁体（图3）。图3 红海、南海现代珊瑚礁地貌剖面与数值模拟裂谷地貌演化过程对比（3）地表作用过程强度是调控浅水珊瑚礁宜居基底规模的关键因素：在所有测试的变量中，地表侵蚀与泥沙输运对潜在宜居基底面积的影响最为突出。高效的泥沙搬运、堆积平抑了陡峭的裂谷地形，沉积物经压实、胶结等成岩作用后，可让宜居基底面积实现8倍以上的增长。该结果可用于解释两类现象：一是红海南部降雨量和地表作用强度显著高于中北部，岸礁分布范围也明显更宽阔（图3，b-c）；二是南海南、北陆缘地貌结构差异显著，如南缘远离陆地，地表作用强度极弱，岛群地貌较北缘保存更完整（图3, e-f）。本研究通过耦合裂谷作用地球动力学过程与地表作用过程，搭建起板块构造学与生物地理学之间的研究桥梁，为理解现今被动大陆边缘珊瑚岛礁空间分布格局背后的地球动力学机制奠定了理论基础。该研究方法充分展现了“地球系统科学”、“生物-地球动力学”等新兴交叉学科的发展潜力，有助于厘清构造演化如何长期作用于高度依赖地貌环境的生态系统。该论文第一作者为博士后雷志斌，通讯作者为研究员夏少红。该研究获得国家重点研发项目、国家自然科学基金项目资助。论文信息：Lei, Zhibin, Shaohong Xia*, Sascha Brune, Michaël Pons, Chenglong Zhang, Tao Gou, Changrong Zhang, and Chaoyan Fan, 2026. Geodynamic controls on the habitable basement of shallow coral reefs at rifted continental margins. Earth and Planetary Science Letters 687, 120073.原文链接：https://doi.org/10.1016/j.epsl.2026.120073

2026-07-30

东莞材料所｜时空耦合硫化学设计稳固超高容量硅负极界面，助力Si90+实用化

锂离子电池（LIBs）在信息终端、电动汽车（EVs）和清洁电力等大行业的发挥着支撑作用，正在迅速发展的低空电动飞行器（如电动垂直起降飞行器EVTOL）和人形机器人等新兴产业需要高能量密度的电池，应具备高能量密度（超过1,000 Wh/L）的同时具有较高的比能量（>400 Wh/kg）。硅基材料被公认为高能量锂离子电池的负极材料，近年来，高比容量负极材料已从硅-碳复合材料转向高硅含量（Si > 90 wt%，即Si90+）材料（图1）。由于高能量密度/比能量、完整的产业链以及优异的加工性能，高镍层状氧化物正极（如LiNi0.9Co0.05Mn0.05O2，简称NCM90）与高容量Si90+负极的组合被认为是一种突破现有电池技术的有效方案，如何在该类负极材料表面形成稳定且适应硅体积膨胀的界面层以保障电池长循环寿命特性是一个行业公认的难题。松山湖材料实验室/中国科学院物理研究所黄学杰研究员与华中科技大学张恒教授合作提出了一种基于时空耦合硫化学（SSC）的非传统方法。该方法将界面调控剂预先嵌入Si90+负极中，并在后续电化学过程中释放，从而在由纳米级Si90+负极与高镍正极组成的电池体系中构建出稳定的界面电位层。通过在Si表面引入非晶碳和硫的双层包覆，预先植入的硫层可在负极腔室的受限区域中发生电化学还原，生成多硫化物中间体。这会立即引发电解质溶剂（如氟乙烯碳酸酯（FEC）和乙烯碳酸酯（VC））的一系列聚合反应，从而形成一种具有弹性且可离子渗透的固态电解质界面（SEI）层，能够充分覆盖Si90+负极表面。基于此，7.3 Ah NCM90||Si90+软包电池实现了优异的循环性能（例如，质量比能量达400 Wh kg−1，体积比能量为1,190 Wh L−1，，循环寿命达1,700次），在能量密度、可持续性、成本效益及其他关键指标方面展现出全面优势（图1）。该文以Spatiotemporally coupled sulfur chemistry for stable silicon-90+ anodes为题目发表在《Nature Communications》(10.1038/s41467-026-76591-4)上。中国科学院东莞材料所/松山湖材料实验室副研究员田孟羽为本文第一作者。基于此，锂离子电池团队已研发出新一代超高能量密度硅基负极电池。图1. 时空耦合硫化学的设计概念图。a) 硅负极在能源供应方面的历史演变；b) 时空耦合硫化学在硅负极表面的作用机制示意图；c) 三代电池技术的全面比较。通过SEM、FIB、STEM、3D PFIB和in-situ Raman等多种表征手段证实，基于SSC的硅负极在100周后的电极膨胀率仅为9.4%，而参比硅负极的电极膨胀率高达近300%。3D PFIB显示了SSC-Si90+在多次循环后完整的SEI膜和电极结构，显示了SSC策略在维持SEI膜和电极完整性方面的有效性。此外，原位拉曼光谱显示，SSC层缓解了Si90+负极在初始过程中的应力蔓延，这对缓解硅负极的体积膨胀至关重要。从原子尺度到电极尺度的多维表征详细阐述了SSC策略在保护硅负极方面的综合作用（图2）。图2. Si90+颗粒和电极的形貌演化。a) Si90+负极的横截面SEM图像；b, c) 100次循环后Si90+颗粒的EDS映射图；d) 利用PFIB采集的切片图像和对Si90+电极进行三维重构的示意图；e) Si90+电极从第1层到第100层的硅体积分数；f) Si90+电极中孔隙、OEM（非活性物质）及硅的体积分数；g) 在恒定电流密度0.36 mA cm−2、电压0.005–1.0 V条件下Si90+负极在锂化过程中的原位拉曼光谱；h, i) 原位拉曼电池的电压随时间变化曲线以及基于拉曼光谱计算出的硅颗粒应力演化趋势。科研团队进一步通过7.3 Ah层叠软包电池对SSC-Si90+负极的实际可用性进行了评估。结果显示，基于SSC-Si90+的电池在循环寿命阈值（即初始容量的80%）方面明显更高，且电解液消耗量更少。例如，>1,700次循环（SSC）对比参考电池的700次循环，这表明薄硫层有效抑制了长期循环过程中的副反应和活性锂损失（图3）。图3系统地测定了三种电池技术在电池组和电动汽车层面的性能特征，第三代电池技术的代表——高镍层状氧化物与SSC-Si90+的新型化学组合，有望成为行业变革的关键。在相同电池组重量的前提下，NCM90||SSC-Si90+在电池组容量、体积、单次充电续航里程及总续航里程方面均展现出全面优势。与目前主流的车用动力电池相比，基于SSC的技术不会带来过高的材料成本负担，例如，19.6欧元/千瓦时（LiFePO4||石墨）对比27.8欧元/千瓦时（NCM622||石墨），以及29.1欧元/千瓦时（NCM90||SSC-Si90+），从而加速其在高能量锂离子电池和电动汽车领域的应用。此外，生产硅基负极材料的用电量远低于传统石墨生产，每生产1千瓦时硅基电池仅消耗约十分之一的电能，如0.91千瓦时（NCM90||Si90+）对比9.27千瓦时（石墨基电池）。这在很大程度上缓解了此前人们对锂电池生产在环境影响与经济效益之间平衡问题及环境保护方面的担忧。图3. 时空耦合硫化学的实际应用。a) 7.3 Ah的NCM90||Si90+软包电池在2.75–4.25 V工作电压下的循环性能；b) 本研究组装的NCM90||Si90+软包电池的关键参数；c) NCM90||Si90+软包电池的光学图像；d) 不同改性方法下多种NCM||Si软包电池的能量密度和循环寿命对比；e, f) LiFePO4||石墨、NCM622||石墨及NCM90|| Si90+电池在pack容量、pack体积、单次充电行驶里程、总行驶里程、成本及生产过程中的电耗方面的比较。文章链接：https://www.nature.com/articles/s41467-026-76591-4来源：新能源材料研究部

2026-08-13

古树天然就是遗传宝库吗？水松全基因组研究揭示种群历史比树龄更关键

古树通常是指树龄在100年以上的树木。它们常见于村落、古道、寺庙等地，在漫长岁月中见证着一代代人的生活与变迁。这些古老生命不仅承载着人们对故乡和历史的记忆，也为鸟类、昆虫、苔藓等众多生物提供栖息空间，并成为记录环境变化的“活档案”。然而，在气候变化、生境退化和人类活动等多重压力下，全球古树正在不断减少。如何让这些跨越世代的生命继续存留下去，正成为文化遗产保护和生物多样性保护共同关注的议题。此外，古树还常被赋予另一层期待。已有研究表明，古树或古老森林能够保留重要的遗传多样性，这也使古树常被视作潜在的“遗传宝库”。这种潜在的遗传价值对于孑遗和濒危植物尤其值得关注。原因在于，这类物种往往经历了长期的分布区收缩、生境破碎化和种群衰退，幸存的古树可能保存着现存种群中已经少见的祖先遗传变异，为未来保护和恢复提供重要资源。另一方面，它们也可能只是经历遗传侵蚀后仍然存活至今的个体，因为对于长寿植物而言，种群衰退造成的遗传后果可能在多个世代后才充分显现。因此，古树的长寿本身是否就意味着更加独特、不可替代的遗传价值，仍需要基因组层面的直接检验。近日，中国科学院华南植物园康明研究团队以极危湿地针叶树水松（Glyptostrobus pensilis）为对象开展保护基因组学研究，为这一科学问题提供了基因组层面的证据。研究发现，古树的进化重要性并不简单由树龄决定，而更多取决于其所属的遗传谱系及其背后的长期种群历史。这一发现为认识古树的进化意义，以及开展濒危植物的精细化保护和种群恢复提供了新的基因组学视角。水松古树正面临消亡风险水松是水松属现存唯一物种，常被称为植物界的“活化石”。它主要生长于沼泽和河漫滩等湿地环境，常形成露出水面或土面的呼吸根，对水文变化较为敏感。其祖先曾广泛分布于北半球，如今却主要残存于中国南方（多见于广东、福建、江西等省份），并零星分布于越南和老挝。目前，水松主要以三种形式存续：约百株散布在村落、寺庙、农田和传统风水林中的古树，约10个极小野生种群，以及近50年来陆续建立的人工栽培群体。也正因为此，水松成为检验古树是否天然就是遗传宝库的理想研究对象。研究团队调查了中国南方和越南59个地点，共采集147株水松，包括64株古树、33株野生树和50株栽培树。本研究中的古树均为具有明确记录、树龄超过100年且生长在人为影响景观中的个体，与残存自然湿地中的野生树相区分。三类个体的年龄结构差异明显：古树绝大多数记录年龄为150至800年；现存规模较大的两个野生种群平均树龄约为85年和112年；栽培树则主要种植于近20至50年。三类个体的胸径差异也与这一年龄结构总体一致。与此同时，不少古树已进入明显的衰退状态。野外调查显示，64株古树中有39株（60.9%）被评估为生长不良或濒死，而野生树和栽培树整体生长状况明显更好，进一步凸显了水松古树保护的紧迫性。水松的保护现状、地理分布和树龄信息古树具有不同的遗传来源和谱系背景为厘清这些古树之间的亲缘关系及水松的种群历史，研究团队组装了约7.93 Gb的染色体水平参考基因组，并对147株水松开展全基因组重测序。亲缘关系分析显示，采自中国南方6个省份的64株古树，其遗传来源并不相同。其中38株与附近现存野生种群亲缘关系较近，部分古树之间还存在明显近亲关系，表明它们很可能来自历史时期的当地引种，且部分来源较为集中；其余26株则与附近野生种群缺乏明显近缘关系，更可能是原有自然种群衰退后遗留下来的孑遗个体。进一步种群遗传的分析发现，现存水松主要分为高度分化的珠江谱系和闽江谱系，同时还存在少数保留较多祖先遗传多态性的祖先—混合类群。两个主要谱系约在23万年前发生分化，此后均经历了长期种群收缩，且这种下降趋势延续至近期，其中闽江谱系的衰退更为明显。由此可见，水松古树既具有不同的历史来源，也分布于不同遗传谱系，并非一个遗传背景一致的群体。水松的遗传亲缘关系及种群结构遗传谱系比保护类型更能解释水松的遗传状况研究团队进一步比较了水松的遗传多样性、杂合度、近交程度、纯化选择效力和潜在有害突变负荷。对66株无近亲关系个体的分析显示，古树、野生树和栽培树的核苷酸多样性分别为2.20 × 10⁻³、1.87 × 10⁻³和1.77 × 10⁻³，差异相对有限；不同遗传谱系之间的差异则更为明显，祖先—混合类群、珠江谱系和闽江谱系分别为3.88 × 10⁻³、1.42 × 10⁻³和6.96 × 10⁻⁴。对全部147株个体的分析以及全基因组杂合度结果也呈现相同趋势。近交、选择效力和突变负荷分析进一步支持这一结果。水松中超过1 Mb的长纯合片段较少，表明近期强烈近亲繁殖并不突出，现有近交格局更多反映长期种群历史。水松的π0/π4为0.65—0.71，处于植物已报道水平的较高区间，显示其纯化选择效力总体较弱。其中，闽江谱系表现出更明显的历史性近交，其基因组上共享ROH区域比例更高，同时具有更高的潜在有害突变负荷，反映出更严重的长期遗传侵蚀。相比之下，按古树、野生树和栽培树划分时，上述遗传指标大多相互重叠，并未显示古树整体具有更优的遗传状况。即使分别在珠江和闽江谱系内部进行比较，这一趋势仍然成立。这表明，相较于保护类型，遗传谱系对水松基因组差异的解释更为明显。水松不同遗传谱系和保护类型的基因组多样性稀有遗传变异揭示古树的遗传不可替代性考虑到水松古树持续衰亡的风险，研究团队进一步评估了古树携带的遗传变异在现存野生和栽培群体中的保留程度。对于常见变异（MAF > 0.05），无论野生群体、栽培群体还是二者合并，均能覆盖古树中95%以上的等位变异，表明这些遗传信息大多已存在于其他个体中。但对于低频变异（MAF ≤ 0.05）及极低频变异（MAF ≤ 0.01），不同古树之间的差异明显增大。自然孑遗古树中这两类变异被现有野生和栽培群体覆盖的比例分别仅为35.6%和6.2%，明显低于历史引种古树的87.7%和57.7%。其中，祖先—混合类群和珠江谱系的部分古树保留了较多未被现有年轻种群充分保存的稀有变异，而不少历史引种古树来源较为集中，所携带的遗传变异重复程度更高。基于66株无近亲关系个体的稀释分析进一步表明，不同类型古树的消失可能带来截然不同的遗传后果。模拟移除自然孑遗古树，或祖先—混合类群和珠江谱系中的古树，可使水松整体核苷酸多样性下降3.5%至15.1%。进一步以个体稀有保留指数评估这些古树的遗传独特性发现，遗传不可替代性较高的个体均来自自然孑遗古树、祖先—混合类群或珠江谱系。综合这些结果，即使同为百年以上的古树，其对水松遗传多样性的贡献也存在显著差异。水松古树遗传变异的保留程度与不可替代性水松基因组研究对古树保护的启示该研究也从基因组层面对古树的遗传价值提供了新的认识。古树的模块化生长和组织更新可能有助于其长期存续，但能够存活数百年，并不意味着这些个体天然具有更加优越的基因组状态。对于一些古树而言，其长期存续还可能更多得益于微避难所、传统文化保护或长期人为管理等外部条件。总体而言，水松古树间的遗传异质性更多由长期种群历史而非树龄本身所解释。类似的逻辑也可能适用于分布更广、种群规模更大的植物。随着2025年国务院《古树名木保护条例》的施行，对于水松等珍稀濒危植物，可在依法保护古树的基础上进一步开展遗传层面的科学评估。在种质保存和种群恢复中，可重点关注代表独特谱系、保留不可替代遗传变异的古树，使这些重要的遗传遗产得到延续。相关研究成果以“Population history rather than tree age contributes to the evolutionary importance of ancient trees in an endangered conifer”为题发表在Nature Plants（《自然·植物》）上。中国科学院华南植物园章为平陈焕镛副研究员为论文第一作者，康明研究员和瑞典乌普萨拉大学Martin Lascoux教授为共同通讯作者。中国科学院华南植物园冯超副研究员、史习佐博士和李守洁博士为论文共同作者。研究得到国家重点研发计划、广东省科技计划、广东省林业局相关项目和中国科学院奖学金计划等资助，并得到有关单位和多位同行的支持与帮助。论文链接：https://www.nature.com/articles/s41477-026-02367-9

2026-08-12

深圳先进院｜高通量双光子荧光寿命显微镜：活体大脑的高分辨、大视野、多脑区、多参量、定量化功能成像

大脑功能是一系列复杂动态行为相互作用的结果，如神经活动、脑血流变化、免疫响应等。这些横跨多个脑区的动态行为能通过协同运作来实现各种大脑功能。因此，如何实现这些动态行为的大规模、高时空分辨、多参量、定量化记录，是深入探索大脑功能的根本所在，也是非侵入式脑机接口获取信息的关键。双光子显微镜（TPM）具备强组织穿透能力和固有的光学层析能力，近年来已成为大脑功能成像研究的首选工具。然而，传统的TPM存在视野受限（通常<0.5 mm²）、成像区域大小与时间分辨率存在固有权衡、仅依赖荧光强度导致信息维度单一等瓶颈，极大制约了其在复杂脑功能研究中的应用。大脑功能是一系列复杂动态行为相互作用的结果，如神经活动、脑血流变化、免疫响应等。这些横跨多个脑区的动态行为能通过协同运作来实现各种大脑功能。因此，如何实现这些动态行为的大规模、高时空分辨、多参量、定量化记录，是深入探索大脑功能的根本所在，也是非侵入式脑机接口获取信息的关键。双光子显微镜（TPM）具备强组织穿透能力和固有的光学层析能力，近年来已成为大脑功能成像研究的首选工具。然而，传统的TPM存在视野受限（通常<0.5 mm²）、成像区域大小与时间分辨率存在固有权衡、仅依赖荧光强度导致信息维度单一等瓶颈，极大制约了其在复杂脑功能研究中的应用。近日，中国科学院深圳先进技术研究院（以下简称“深圳先进院”）生物医学与健康工程研究所、医学成像科学与技术系统全国重点实验室郑炜/叶世蔚团队成功研制出大视野多区域高速双光子荧光寿命显微镜（LD-2P-FLIM），可同步监测多个大脑皮层区域的神经元活动、同时空高分辨地记录生理/病理条件下的神经血管耦合现象、长时间追踪小胶质细胞对神经元损伤的免疫过程、以及实现大规模神经元集群的定量钙成像（活体监测绝对钙离子浓度），为非侵入式脑机接口提供了新的信息采集范式。研究成果以"Large-FOV, dual-region, two-photon fluorescence lifetime imaging microscopy (LD-2P-FLIM) for multiparameter and quantitative brain function imaging"为题发表于《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上。该研究工作是国自然重大科研仪器研制项目的主要成果，同时也得到了医学成像科学与技术系统全国重点实验室、国家重点研发计划、深圳市医学研究专项等项目的资助。论文共同第一作者为中国科学院深圳先进技术研究院叶世蔚副研究员、高玉峰副研究员和邓梦颖副研究员。郑炜研究员和叶世蔚副研究员担任通讯作者。研究工作同时得到了郑海荣院士的指导，合作者还包括中国科学院深圳先进技术研究院刘成波研究员团队、储军研究员团队、南方医科大学珠江医院郭燕舞教授团队。大视野多区域高速双光子荧光寿命成像技术针对前述的传统TPM瓶颈，研究团队发展了相应技术（如下图所示）：（1）研发了一种有效的自适应光学校准方法，可突破物镜的标定视野限制，在仅使用商用光学器件的条件下实现了视野直径可达3mm且维持全视野分辨率优于0.7μm的大视野高分辨双光子成像。（2）为了缓解成像区域大小与时间分辨率二者间的制衡矛盾，研发了基于时分复用原理的多区域同步成像系统，可在全视野范围内任意选择两个子区域进行同步监测，子区域的三维定位和视野大小均可独立调节。（3）研发了一个现场可编程门阵列（FPGA）模块，可在强度成像的基础上实现荧光寿命的同步、快速探测，其荧光寿命成像的数据通量可达15.73 MP/s（512像素、30Hz、双区域）。相比于传统的荧光寿命成像方法（时间相关单光子计数，TCSPC）,该FPGA模块实现了超200倍数据通量的提升，使得活体动物的实时FLIM成像成为可能。基于LD-2P-FLIM的多参量和定量化大脑功能成像研究基于研发的LD-2P-FLIM，研究团队在多参量和定量化大脑功能成像方面开展了一系列探索研究，展示了该技术在脑科学研究与应用中的潜力。大视野高分辨的神经结构与功能成像。LD-2P-FLIM不仅能在3mm的完整视野内清晰识别树突棘结构，而且可以同步探测超过3000个神经元的钙离子活动，并推测相应的神经电位信息。多脑区神经活动同步监测。研究团队实现了疼痛刺激下横向（运动皮层M1和感觉皮层S1）和轴向（感觉皮层的L1和L2/3）双区域的神经活动同步监测，助力于梳理多个脑区的关联特性，为完整解析大脑功能提供重要手段。长时间追踪小胶质细胞对神经元损伤的免疫过程。研究团队利用两种不同寿命的绿色荧光蛋白（EGFP和BrUSLEE）分别标记小胶质细胞和神经元，并在激光损伤神经元后长时间追踪小胶质细胞对局部神经元损伤的免疫过程。同时空高分辨地记录生理/病理条件下的神经血管耦合现象。研究团队发现常用于活体神经元和血管标记的GCaMP6s和FITC虽然都是绿色的，但是它们的荧光寿命存在显著差异。因此，基于这一标记策略，进一步结合LD-2P-FLIM，研究团队实现了电刺激和癫痫模型下神经血管耦合现象的双区域同步记录。这一成像实验不仅是在高效的单一波长激发下完成的，而且所记录到的神经血管耦合特征是完全共时空的。研究发现，得益于LD-2P-FLIM高通量的荧光寿命成像能力，神经和血管信号能被高分辨、无串扰、实时监测。此外，双区域同步成像性能帮助揭示了一些特殊的神经血管耦合时空特征，而大视野高分辨成像性能则帮助解析了毫米尺度、单分子水平癫痫病灶的发生和传播机制。大规模神经元集群的定量钙离子成像。光学钙成像是系统神经科学中研究群体神经活动的核心技术，然而传统钙成像技术的一大限制就是无法将测得的荧光强度信息转化为钙离子浓度信息。而荧光寿命成像不受荧光物浓度和激发条件（激光强度、波长、光路等）影响，可以直接反映钙离子浓度信息。然而，传统的荧光寿命探测往往是基于TCSPC的，成像通量低（获得一幅512像素的荧光寿命图像可能需要数十秒甚至几分钟）。而LD-2P-FLIM正是瞄准这一痛点，在jRCaMP1b标记神经元的活体小鼠上首次实现了大规模神经元集群、双区域的定量钙离子成像。研究团队还比较了自发活动和癫痫状态下测得钙离子浓度水平，发现这两种状态下测得的钙离子浓度差异与脑电极（EEG）测得结果几乎一致。这一结果表明LD-2P-FLIM有望将光学钙成像研究从原有的定性水平推进到定量水平。未来展望LD-2P-FLIM可在大视野范围内、以亚细胞分辨率、同步监测两个关联脑区上的神经血管耦合、神经元-小胶质细胞互作机制、定量钙离子变化等大脑功能信息，有望为下一代脑机接口技术提供新范式和新思路。未来研究可在成像技术与大脑功能成像应用两个层面展开。在成像技术方面，可结合低重频高脉冲能量的激光器以实现更多区域的同步成像，并研究免拟合式的荧光寿命计算方法以实现荧光寿命值的实时获取。在大脑功能成像方面，可以结合更多新兴发展的荧光寿命探针，为各种神经化学物质（cAMP, 神经递质、神经调质等）的在体、定量成像研究提供可靠的成像工具。论文链接大视野多区域高速双光子荧光寿命成像方法和系统。大视野高分辨的神经结构与功能成像。同时空高分辨地记录生理/病理条件下的神经血管耦合现象。癫痫状态下大规模神经元集群的定量钙成像。

2026-08-10

Biological Reviews | 揭示喙鲸声学适应与人为噪声威胁，呼吁加强深海鲸类保护研究

近期，中国科学院深海科学与工程研究所海洋哺乳动物与海洋生物声学研究团队在生物学领域顶级期刊Biological Reviews在线发表了题为“Beaked whale bioacoustics: knowledge gaps, vulnerability, and conservation imperatives in the Anthropocene”的论文。该研究系统总结了过去二十余年来全球喙鲸（Ziphiidae）生物声学研究进展，分析了喙鲸独特的声学适应、听觉能力及其对人为水下噪声的潜在风险，指出由于长期存在的观测困难和基础数据不足，当前对这一类深潜鲸类的生态知识和人为扰动影响仍存在显著认知缺陷。喙鲸是一类长相奇特的齿鲸：嘴巴像海豚般突出，但更窄长，宛如鸟喙。全球现存24种，从热带到极地都有分布。它们极度害羞，一生大部分时间在深海中度过，每次浮出水面仅换气几分钟就再次下潜少则10-20分钟，长则几十分钟甚至几小时（最长纪录将近4小时）才再次浮出水面。这让科学家极难在海上直接观察到它们。直到近20年来，借助水下麦克风（水听器），人们才开始窥探它们的水下生活。论文指出，喙鲸已经进化出高度特化的声学系统，依靠具有物种特异性的调频（frequency-modulated, FM）回声定位（又称“生物声呐”）信号进行深海觅食和环境感知，其生物声呐频率与体型之间存在显著的进化关联，呈现趋同演化下的“逆频率缩放”定律。通过整合10个物种的数据，该研究首次系统验证了喙鲸家族内部也存在“体型越小，回声定位信号频率越高”的逆比例关系。这与海豚、鼠海豚的规律高度一致，表明深潜生态压力迫使不同支系的齿鲸在声呐设计上趋向同一最优解。这是进化生物学的重要认知补充。同时指出，喙鲸具有特殊的听觉结构和声学传导路径，使其能够适应深海环境中的高频声学探测和交流。然而，正是这种高度依赖声音的信息获取方式，使喙鲸成为人为噪声影响最敏感的海洋动物之一。随着人类活动不断向深海扩展，包括船舶运输、地质调查、军事声呐、海底工程以及未来深海采矿活动在内的多种人为声源正在改变海洋声景。已有研究显示人为噪声可能导致喙鲸停止觅食、改变潜水行为、回避噪声源，甚至与部分集体搁浅事件相关。该研究指出，目前针对喙鲸的噪声影响评价标准仍受到物种特异性生理和行为数据不足的限制，难以建立充分可靠的声学保护阈值。长期以来，喙鲸研究主要集中于少数容易开展研究的物种，尤其是与军事活动区域存在空间重叠的种类，而其他多数喙鲸物种仍缺乏充分的声学、行为和生态数据。论文指出，目前相当一部分喙鲸物种甚至尚未获得可靠的声学记录，已有研究结果也不能简单推广至整个喙鲸科。由于不同物种可能具有不同的声学策略、栖息需求和噪声响应模式，缺乏物种尺度的数据将限制保护措施的科学制定。研究团队进一步指出，当前深海保护面临的核心问题不仅是人为扰动是否存在，而是生态系统对扰动的响应机制仍未被充分认识。特别是在深海人为活动不断增加的背景下，如何建立基于科学证据的环境影响评估体系，需要更加完善的长期监测和基础数据支撑。论文提出未来研究应重点加强全球被动声学监测网络建设，提高喙鲸分布和种群规模估计能力，开展更多物种的听觉能力研究，量化不同人为声源造成的生态影响，并进一步评估个体行为变化是否会转化为种群尺度效应。研究认为，未来需要将长期声学监测、生物遥测、生态模型和环境数据相结合，建立更加完善的风险评估体系，为深海人为活动中的生态保护和适应性管理提供科学依据。对于喙鲸等深海关键物种而言，加强基础生态认知、完善长期监测体系、建立物种特异性的噪声管理标准，是实现深海生态系统可持续管理的重要基础。该论文的第一作者为中国科学院深海科学与工程研究所海洋哺乳动物与海洋生物声学研究室董黎君副研究员。研究得到国家自然科学基金、国家重点研发计划以及海南省科技人才创新项目等项目支持。图1 喙鲸回声定位信号频率与体型之间的关系图2 喙鲸与其他海洋哺乳动物听觉阈值比较（包括白鲸、港湾鼠海豚、虎鲸、瓶鼻海豚，以及幼年杰氏中喙鲸、成年杰氏中喙鲸和亚成年柏氏中喙鲸等）

2026-08-07

深圳先进院｜研究提出非接触激光超声实现锂离子电池SoC/SoH精准监测

随着新能源汽车与新型储能产业的持续发展，锂离子电池在复杂工况下的安全性、可靠性与寿命管理问题日益凸显。荷电状态（state of charge, SoC）表征电池当前可用电量，健康状态（state of health, SoH）反映电池经长期循环后的性能退化程度，二者是电池管理系统中实现寿命预测与安全预警的关键参量。在高倍率充放电条件下，电池极化效应、电压滞后及温度波动显著加剧，对内部状态监测的准确性和稳定性提出了更高要求。7月29日，中国科学院深圳先进技术研究院智能仿生研究中心郭师峰团队与清华大学深圳国际研究生院周光敏团队合作，在Science Advances上发表题为"Operando state monitoring of diversified lithium-ion batteries via laser-excited ultrasonic sensing with transformer networks"的研究成果。该研究面向高倍率工况下锂离子电池SoC与SoH的高精度原位监测需求，提出“非接触激光超声传感”与“Transformer深度学习”一体化融合方案，旨在突破传统超声及电化学估算方法在工程应用中的局限，并通过构建覆盖多型号商业电池的大规模数据集，系统验证了该方法的泛化能力与适用性。现有电池状态估计方法多依赖电压、电流和内阻等电化学参数，但在高倍率循环过程中，复杂的电化学动力学及热效应会显著削弱该类方法的适用性。近年兴起的超声检测技术，因对材料弹性模量、密度及内部结构演化高度敏感，为电池内部状态的无损感知提供了新的解决路径。然而，当前主流的接触式和浸液式压电超声方法普遍依赖耦合剂或浸液介质，检测结果易受耦合状态及温度波动影响，同时耦合剂残留也限制了其在真实应用场景中的推广。针对上述问题，研究团队提出了一种无需耦合剂的非接触激光激励超声传感技术（LEUS），并结合Transformer网络实现电池状态的实时原位监测。该LEUS系统采用环形脉冲激光与连续激光协同的双激光设计方案，大幅提升了超声信号强度与信噪比，能够有效追踪与电池SoC和SoH密切相关的内部状态演化。通过将超声信号转化为时频谱图，Transformer网络可自动提取与SoC、SoH相关的判别性特征，减少对人工特征构建和经验参数设定的依赖，同时实现高精度预测。借助迁移学习，该基础模型可快速适配不同电池化学体系、型号及高倍率循环条件，显著降低重训练时间和成本，且仅需少量超声数据即可实现稳定状态监测。在来自多种型号电池、超过10万个超声信号样本的大规模验证中，该方法展现出较强的鲁棒性和可靠性，为下一代电池管理系统的构建提供了有力技术支撑。该研究贯通了非接触超声信号采集、多场景电池数据构建及深度学习状态推断等关键环节，为复杂工况下锂离子电池无损、实时与智能化的状态监测提供了全新的解决方案，有望为高安全性、高智能化电池管理系统的发展奠定技术基础。郭师峰研究员、冯伟研究员和周光敏副教授为该论文共同通讯作者，吕高龙博士与孙崇博博士为共同第一作者。该研究获得国家重点研发计划、国家自然科学基金、广东省及深圳市基础研究项目的资助支持。原文链接用于电池荷电状态（SoC）和健康状态（SoH）实时监测的全非接触式激光超声与机器学习模型示意图

2026-08-07